Cela fait 11 mois que la guerre a commencé, au début la Terre croyait pouvoir gagner grâce à sa supériorité numérique, mais ce n'est pas le cas et se trouve en difficulté face aux armures mobiles ennemis. C'est dans le but de contrer les armures du ZAFT que le projet Gundam d'armure mobile et le projet Archangel, un nouveau type de vaisseau sont lancés. Apprenant l'éxistance du projet Gundam, ZAFT lance une opération pour voler les 5 prototypes. Cependant, ces armures se trouve sur l'une des rares colonie restez neutre dans ce conflit. Le peu de force de l'alliance terrestre se fait décimer par les Jins ennemis. Le commando du ZAFT s'empare de 3 des prototypes, les 2 derniers étant encore dans l'usine. Pendant l'attaque du ZAFT, l'évacuation de la colonie est ordonné. Intrigué par une personne qui ne ejoignait pas les modules de survie, Kira ( le hero )est surpris de découvrir qu'il s'agit d'une fille. Suite à une explosion, ils ne peuvent revenir sur leur pas et foncent vers l'usine. Là ils découvrent les 2 derniers gundams. Kira précipite la fille dans un accès individuel pour rejoindre un module de survie. Une soldat lui dit de le rejoindre, mais celle-ci est blessé par le dernier menbre du commando. Ce soldat n'ayant plus de munition se précipite vers elle pour la terminer au couteau. Seulement alors qu'il n'est plus qu'à 2 ou 3 mètres Kira reconnaît l'assaillant comme étant Asuran Zara, un ami qu'il a