Le temps passe et très vite la carrière de star de Ranka s'améliore et sa popularité augmente exponentiellement, la menant quasiment au rang de diva elle aussi, alors que la santé de Sheryl se détériore rapidement, tout comme son aura auprès du publique, et cela après s'être effondré au cours d'une performance live. Dans le même temps, des factions ennemies et secrètes manœuvrent dans les coulisses, et naturellement cherchent à contrôler la horde Vajra en utilisant les capacités particulières des chansons des deux divas toujours en concurrences pour l'affection d'Alto. L'ensemble de la flotte Macross Frontier qui a bien souffert des précédents combats s’apprête à mener sa dernière guerre contre les Vajra, car ce trouvant le dos au mur faute de moyens et de ressources pour continuer a vivre normalement. Alto Saotome prend vite conscience de la situation dramatique de la flotte, et enfin en écoutant son cœur fait finalement le choix définitif entre Ranka et Sheryl. Dans le même temps ses amis enquêtent, et tentent de faire face aux machinations de leurs adversaires. Que va devenir la flotte Macross Frontier et notre trio love ?