Après avoir frôlé l'extinction lors de la guerre contre les zentradiens, l'humanité a pris conscience de la précarité de son existence et les instances internationales ont décidé de lancer un programme d'expansion et de colonisation spatiale. En 2059, la vingt cinquième flotte d'expansion, Macross Frontier, continue son voyage à travers l'univers. C'est sur ce mega vaisseau colonisateur que débarque la méga star Sherryl Nome pour s'y produire en concert. Alto, jeune élève pilote de l'académie, offre deux place à son amie Ranka, grande fan de la chanteuse. Alors que toute l'attention de la colonie est tournée vers le concert-évènement, une forme de vie extra-terrestre se manifeste non loin de là et menace la quiétude des colons...
Après avoir frôlé l'extinction lors de la guerre contre les zentradiens, l'humanité a pris conscience de la précarité de son existence et les instances internationales ont décidé de lancer un programme d'expansion et de colonisation spatiale. En 2059, la vingt cinquième flotte d'expansion, Macross Frontier, continue son voyage à travers l'univers. C'est sur ce mega vaisseau colonisateur que débarque la méga star Sherryl Nome pour s'y produire en concert. Alto, jeune élève pilote de l'académie, offre deux place à son amie Ranka, grande fan de la chanteuse. Alors que toute l'attention de la colonie est tournée vers le concert-évènement, une forme de vie extra-terrestre se manifeste non loin de là et menace la quiétude des colons...